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Un herbario es un repositorio de especímenes de plantas preservadas, principalmente secas, a ser usadas como colección de referencia para estudios en taxonomía, sistemática, historia natural, ecología, genética, farmacología, y biología molecular. El Herbario UPRRP esta establecido para ser una colección de referencia no solo para Puerto Rico, sino también para el Caribe.  Por esta razón tenemos un programa activo de colectas de las plantas de Puerto Rico, los duplicados de estas colecciones se hacen para intercambiar con otras instituciones. Actualmente en el Área del Caribe, nuestro Herbario es uno de los más activos en crecimiento y que mayor numero especímenes provee para investigación. Nuestras colección consiste en sobre 45,000 especímenes con espacio para almacenar aproximadamente 40,000 más. Al presente nuestra colección incluye las siguientes taxa: Traqueófitas, Briofitas, Algas y Hongos. Además tenemos una pequeña biblioteca que responde a las necesidades de identificación de plantas del Caribe.